刷机后短信仍然存在的原因可能有以下几点：
1. 短信数据备份：在刷机之前，如果手机进行了短信数据的备份，那么在刷机后，短信数据会从备份中恢复。
2. 系统分区备份：在刷机过程中，如果选择了保留用户数据的选项，那么手机中的用户数据，包括短信，会保留在原系统中。这意味着刷机后，短信仍然可以找到。
3. 云服务同步：如果手机开启了云服务，并且之前将短信同步到了云端，那么在刷机后，短信会从云端恢复。
4. 第三方应用：有些第三方短信应用可能会将短信数据保存在应用程序的数据库中，即使系统被刷机，这些数据也不会丢失。
5. 误操作：有时候，用户可能误以为短信被删除了，但实际上短信仍然存在。
如果想要确认短信为什么还存在，可以尝试以下步骤：
检查备份：查看是否有短信的备份文件。
检查云服务：登录到相应的云服务账号，查看是否有短信同步到云端。
检查第三方应用：检查是否有第三方短信应用可能保存了短信数据。
检查手机设置：检查手机设置中是否有短信保留的选项。
如果确认短信数据不应该存在，可能需要进一步清理或恢复。
